ישנם גופים בהם החותמים על העברת המשכורות הינם המנכ"ל וסמנכ"ל הכספים, וישנם גופים בהם החותמים הם סמנכ"ל הכספים והחשב.

החתימה צריכה לשקף את יכולתו של החותם לבקר את אמינות הסכומים שחושבו ולהבין את מהותם והתהליכים שיצרו אותם.

ישנם גופים בהם החשב, המוגדר כאחראי על השכר, אינו מוכן לחתום על ההעברה הבנקאית של המשכורות, משום שאין ברשותו, לדעתו, כלים נאותים לבקר את חישוב השכר.

בגופים רבים מקובל שמדור השכר מקבל נתונים אודות העובדים ממדור כוח אדם, המנהל רישום מצב אישי של העובד, דרגתו, היעדרויות וכדו'. מקובל להכפיף את מדור השכר לסמנכ"ל הכספים/חשב כדי לאפשר להם שליטה ובקרה על הנעשה בתחום זה.

בדיקות שוטפות של חישוב השכר צריכות להתבצע על ידי עובדים שאינם תלויים במבצעי השכר, ובעלי ידע וכישורים לביצוע הבדיקות. בודקי השכר יכולים להיות כפופים לסמנכ"ל הכספים/חשב, יכולים להיות ממדור הנהלת החשבונות, ואפילו כפופים למנהל מדור השכר.

אין זה מתפקידו של מבקר הפנים לבצע בדיקות שוטפות אלו, הוא יכול לבדוק קיום נוהל, ביצוע הנוהל, ולפעמים לבדוק את השכר.

החותמים על ההעברה הבנקאית של השכר צריכים לההעלות על הכתב נוהל ברור של בדיקות שוטפות של השכר, הכולל את האחראים לביצוע הבדיקות, טכניקות בדיקה, תדירות הבדיקות, שיטות הדגימה, והכל כדי להבטיח מיומנות, מקצועיות ואי-תלות, וכדי שיוכלו לחתום על ההעברה הבנקאית.